Há 40 anos um poderoso pokémon, Celebi, escapou por pouco de umcaçador especializado em capturare vender pokémons raros. Juntamente com Sammy, um garoto, Celebi usou seus poderespara viajar no tempo e escapar da ameaça. Já no presente Sammy encontraAsh, Pikachu e seus amigos, a quem pede ajuda já que Celebi está esgotado pelo esforço feito pela viagem. Entretanto ogrupo terá queenfrentar um poderoso vilão,que possui uma pokébola capaz de transformaros pokémons capturados em criaturas malignas e poderosas.
